文章發表

  • 作者:
    賴昆祺,鄭又華,陳岳智,李祐陞,邵廣昭
    發表年代:
    2012
    發表期刊:
    2011數位典藏地理資訊學術研討會論文選集
    摘要:
    物種出現紀錄包含博物館動物標本、植物標本、生態調查與物種觀察等資料,在TaiBIF物種出現紀錄整合平台中,已整合台灣超過26個資料集與150萬筆物種出現紀錄,且約85%以上的資料具有地理資訊,大量的空間資訊隨之衍生出許多熱門探討之議題,而空間知識探索(Geospatial Knowledge Discovery)亦常被使用於大量空間的研究中,常用的方法之一為空間資料聚類分析,透過聚類分析可以更清楚地發現空間資料之特性。
    因此本研究將採用空間聚類分析方案,利用DBSCAN演算法作為主要聚類分析技術,並提供使用者自行決定兩個變數,分別為鄰近區域的半徑(Eps)及至少存在於該鄰近區域的點數(MinPts),分析後的群聚結果再搭配電腦圖學的演算法(Convex hull與Polygon clipping兩種演算法)於Google Maps上繪製出物種出現記錄的多邊形,以此方法解決大量物種出現紀錄於Google Maps上呈現效能與視覺化之問題,透過本研究可快速且有效地利用Google Maps呈現物種分布資料,進而幫助研究者挖掘出大量資料所隱含的知識。
    關鍵字:
    DBSCAN演算法、物種出現紀錄、Google Maps
  • 作者:
    邵廣昭
    發表年代:
    2011
    發表研討會:
    生物多樣性推動方案實務訓練班
    摘要:
    2011 年生物多樣性推動方案實務訓練班講義
  • 作者:
    鄭又華*、林永昌、李瀚、邵廣昭
    發表年代:
    2011
    發表研討會:
    2011年動物行為、生態暨環境教育研討會
    摘要:
    為配合行政院「生物多樣性推動方案」,國科會於2001~2003年專案支助建置「台灣物種名錄」(Catalogue of Life in Taiwan)資料庫(原台灣生物多樣性資訊網,簡稱TaiBNET, http://taibnet.sinica.edu.tw)。內容旨在建立與維護台灣分類與生態之專家名錄,以及由上百位國內分類學者共同製作的台灣物種電子名錄。本網站亦提供完整的網路查詢服務功能,如由學名、俗名或同物異名之字串查詢、由分類樹狀名錄查詢;此外,亦提供學名核對工具、名錄下載,並支持合作網站之學名連結,以相互擷取物種相關資訊。
    2009年開始發展線上修訂系統,提供專家學者即時修訂名錄之功能,大為提高編輯效率。至2010年12月初為止,共收錄7+1界,包含病毒495種,細菌435種,古菌6種,原生生物1,378種,原藻界1,950種,真菌5,934種,植物7,637種,動物35,217種,累計53,052種,同物異名53,548筆。中文名部分,目前已收集科級以上中文名3,414個,物種中文名28,903個,未來仍須持續努力。外來種(包含栽培種)及古生物(化石種)之名錄也正另行建置中。此外為達推廣之目的,本站之名錄資料亦於「台灣生物多樣性入口網」(TaiBIF, http://taibif.org.tw),以及由數位典藏與數位學習國家型科技計畫(TELDAP)所建置的「數位台灣文化入口網:文化與自然」(http://culture.teldap.tw)同步公開。在與Species2000的密切合作下,參考並採用其資料結構,以期達到未來物種名錄資訊之國際交流與共享。
    關鍵字:
    物種名錄、學名核對、線上修訂系統、TaiBNET
  • 作者:
    鄭又華*、蔡素甄、許正欣、賴昆祺、柯智仁、邵廣昭
    發表年代:
    2011
    發表研討會:
    2011年動物行為、生態暨環境教育研討會
    摘要:
    為落實生物多樣性推動方案之要求,並鼓勵、促進基礎分類學研究,國科會提撥專案經費協助國內分類學者撰寫物種描述資料,紀錄台灣之生物多樣性,而TaiBIF則應國科會要求,將出版之生物誌資料電子化上線,供各界前往瞭解。「生物誌內容管理系統」是在原本PHP+MySQL網站資料庫的基礎之上,利用Drupal及生命大百科開發的LifeDesks模組群,強化原有的網站設計,始能提供便利的內容管理功能,針對系統分類學者的習慣,有彈性地整理名錄、描述、文獻條目、影像等資料,且能按照國際標準輸出及交換資訊。
    藉由此系統的開發,生物誌的研究團隊可將所欲維護的物種資料集中於線上管理,避免傳統出版流程中檔案紊亂、版本不一致、再版時需重複所有流程的問題,且未來不同形式的出版需求亦能得益於此一集中管理的系統,支援如物種百科網站、電子書、電子出版等等工作。本系統開發所使用之程式碼及模組均以GPL授權公開,冀望在開發層次,生物多樣性的研究社群亦能共享此一資源,以改善此領域中缺乏長期開發人力的問題。
    關鍵字:
    生物誌、系統、內容管理、Drupal
  • 作者:
    賴昆祺*、鄭又華、陳岳智、柯智仁、許秀雯、許正欣、陳麗西、邵廣昭
    發表年代:
    2011
    發表研討會:
    2011年動物行為、生態暨環境教育研討會
    摘要:
    標本是記錄物種資訊最直接的探查研究方式,除了是重要之分類研究基礎及歷史見證,亦是提供往後生物學研究及保育工作者分類鑑定之重要指標,並作為一般生物科學教學之參考。不論在分類學、生態學資源調查及生物技術開發等方面的研究,都必須有標本作為證據,以提供將來查證比對之用。有鑑於此,2001年所啟動數位典藏國家型科技計畫,有部分的目標希望將各標本館的標本數位化,可以透過單一平台達到跨館的查詢,進而達到標本交換與資源互惠共享之最終目標,而數位典藏計畫進入二期後,此平台則由TaiBIF所維護。
    目前在TaiBIF的物種出現紀錄(廣泛的物種出現紀錄包含博物館動植物標本與生態調查及觀測)資料整合平台中,資訊架構主要是利用TAPIR將分散的資源串連起來,並使用jqGrid與Google Map為核心呈現資料的兩個元件,透過四種不同功能以協助查詢出現記錄,功能如下: 1.學名關鍵字查詢:除了將物種現有學名納入搜尋外,也將同物異名整合在標本搜尋的範圍,利用此功能檢視過去不同研究階段所使用學名的標本。 2.物種瀏覽:以台灣物種名錄分類階層為主,進行相關物種出現記錄瀏覽。 3.單位瀏覽:以資料提供單位進行瀏覽。 4.地圖瀏覽:以地理空間進行查詢,包括矩形檢索與不規則多邊形的檢索方式。
    關鍵字:
    標本、物種出現記錄、TaiBIF、Google Map

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