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無危 Least Concern
- Acanthastrea echinata Dana, 1846 大棘星珊瑚
- Accipiter gularis gularis (Temminck & Schlegel, 1844) 日本松雀鷹
- Accipiter soloensis (Horsfield, 1821) 赤腹鷹
- Accipiter trivirgatus formosae Mayr, 1949 鳳頭蒼鷹(台灣特有亞種)
- Accipiter virgatus fuscipectus Mees, 1970 松雀鷹(台灣特有亞種)
- Acmella paniculata (Wall. ex DC.) R. K. Jansen, 1985 金鈕扣
- Acorus gramineus Soland., 1943 石菖蒲
- Acridotheres cristatellus formosanus Hartert, 1912 八哥(台灣亞種)
- Acropora clathrata (Brook, 1891) 方格軸孔珊瑚
- Acropora cytherea (Dana, 1846) 輻板軸孔珊瑚
- Acropora elseyi (Brook, 1892) 旁枝軸孔珊瑚
- Acropora gemmifera (Brook, 1892) 芽枝軸孔珊瑚
- Acropora grandis (Brook, 1892) 巨枝軸孔珊瑚
- Acropora latistella (Brook, 1892) 盤枝軸孔珊瑚
- Acropora microphthalma (Verrill, 1869) 小葉軸孔珊瑚
- Acropora pulchra (Brook, 1891) 叉枝軸孔珊瑚
- Acropora robusta (Dana, 1846) 強壯軸孔珊瑚
- Acropora samoensis Brook, 1891 三毛亞軸孔珊瑚
- Acropora sarmentosa (Brook, 1892) 短小軸孔珊瑚
- Acropora subulata (Dana, 1846) 淺盤軸孔珊瑚
- Acropora tortuosa (Dana, 1846)
- Acropora valenciennesi (Milne Edwards & Haime, 1860) 華倫軸孔珊瑚
- Acropora valida (Dana, 1846) 變異軸孔珊瑚
- Acropora yongei Veron & Wallace, 1984 楊氏軸孔珊瑚
- Acrostichum aureum L., 1753 鹵蕨
- Actinodura morrisoniana Ogilvie-Grant, 1906 臺灣斑翅鶥
- Aix galericulata (Linnaeus, 1758) 鴛鴦
- Alveopora tizardi Bassett-Smith, 1890 平滑汽孔珊瑚
- Amorphophallus paeoniifolius (Dennst.) Nicolson, 1977 疣柄魔芋
- Anous stolidus pileatus (Scopoli, 1786) 白頂玄燕鷗
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