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極危 Critically Endangered
- Alnus henryi C.K. Schneid. 臺北榿木
- Aythya baeri (Radde, 1863) Baer'sPochard
- Carpinus hebestroma Yamam. 太魯閣千金榆
- Cinnamomum kotoense Kaneh. & Sasaki 蘭嶼肉桂
- Citrus taiwanica Tanaka & Shimada 南庄橙
- Cryptocarya elliptifolia Merr. 菲律賓厚殼桂
- Cypripedium segawae Masam., 1933 寶島喜普鞋蘭
- Diospyros vaccinioides Lindl. 楓港柿
- Eretmochelys imbricata Conant, 1991 鷹嘴海龜
- Euonymus pallidifolia Hayata, 1913 淡綠葉衛矛
- Gastrochilus deltoglossus T.C. Hsu, S.I Hsieh, J.H. Wu & H.C. Hung 三角唇松蘭
- Geothelphusa lanyu Shy, Ng & Yu, 1994 蘭嶼澤蟹
- Geothelphusa lutao Shy, Ng & Yu, 1994 綠島澤蟹
- Leucogeranus leucogeranus (Pallas, 1773) 白鶴
- Paulownia kawakamii T. Itô 川泡桐
- Pinanga tashiroi Hayata 山檳榔
- Pyrenaria buisanensis (Sasaki) C.F. Hsieh, S.Z. Yang & M.H. Su 武威山烏皮茶
- Thalasseus bernsteini (Schlegel, 1863) 黑嘴端鳳頭燕鷗
