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- Ziziphus jujuba var. inermis (Bunge) Rehder 無刺棗
- Ziziphus mauritiana Lam. 印度棗
- Ziziphus vulgaris var. inermis Bunge 大棗
- Zizula hylax (Fabricius, 1775) 迷你小灰蝶
- Zobellella denitrificans Lin Y.T. & Shieh W.Y., 2006
- Zobellella taiwanensis Lin Y.T. & Shieh W.Y., 2006
- Zodiomyces subseriatus Thaxter 成列大托蟲囊菌
- Zombrus bicolor (Enderlein, 1912)
- Zonaria diesingiana J.Agardh 1841 圈扇藻
- Zonaria flabellata (Okamura) Papenfuss 扇狀圈扇藻
- Zonaria stipitata Tanaka & K.Nozawa 1962 有柄圈扇藻
- Zonitis cothurnata Marseul, 1873 端黑黃芫青
- Zonitis japonicus Pic, 1910 黃芫青
- Zonitis miwai Kono, 1936 三輪黃芫青
- Zonitoides arboreus (Say, 1816) 樹琥珀蝸牛
- Zonitoides fromosana (Hirase, MS) 臺灣琥珀蝸牛
- Zonodoropsis pallens Poppius, 1915
- Zonoplusia ochreata (Walker, 1865) 帶鎍夜蛾
- Zonosagitta bedoti Beraneck, 1895
- Zonosagitta pulchra Doncaster, 1902
- Zoodes formosanus Niisato, 1982 狹胸姬山天牛
- Zoogloea sp. Chen
- Zoopsis liukiuensis Horik.
- Zoothamnium arbuscula
- Zoothera aurea aurea (Holandre, 1825) 虎鶇
- Zoothera aurea toratugumi (Momiyama, 1940) 虎班地鶇
- Zoothera dauma dauma (Latham, 1790) 虎鶇
- Zophoessa dura subsp. neoclides (Fruhstorfer, 1909) 黛眼蝶
- Zophoessa niitakana (Matsumura, 1906) 玉山幽眼蝶
- Zophoessa siderea subsp. kanoi (Esaki & Nomura, 1937) 鹿野黑蔭蝶
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