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- Idiotephria nakatomii Inoue, 1978 黃珠波斑尺蛾
- Idioteuthis cordiformis (Chun, 1908) 心鰭鞭魷
- Idiozetes javensis Hammer, 1979
- Idonia (Cryptopidonia) fushani Kuboki, 1993 福山氏隱姬花天牛
- Idozees erectus Aoki, 1976 鍬形隆腹甲蟎
- Idozees javensis Hammer, 1979
- Idriella fertilis (Pirozynski & Hodges) Matsushima
- Idriella lunata Nelson & Wilhelm 新月花頂孢黴
- Idriella mycogonoidea Matsushima 產菌黴狀花頂孢黴
- Idriella taiwanensis Matsushima 臺灣花頂孢黴
- Iduna aedon rufescens (Watson, 1985) 厚嘴葦鶯
- Iduna caligata (Lichtenstein, 1823) 靴籬鶯
- Ihlea punctata Forkal, 1775
- Iiella pelagica (Ii, 1964) 漂浮囊糠蝦
- Ijimaia dofleini Sauter, 1905 軟腕魚
- Ilea fascia (Müller) Fries.
- Ilema arizana Wileman, 1910
- Ilema kosemponica (Strand, 1914)
- Ilema nachiensis (Marumo, 1917)
- Ilema nigrofascia (Wileman, 1911)
- Ilema olivacea (Wileman, 1910)
- Ilema wilemani Wu & Fu, 2013 韋氏灰毒蛾
- Ilex arisanensis Yamam. 阿里山冬青
- Ilex asprella (Hook. & Arn.) Champ. ex Benth. 燈稱花
- Ilex bioritsensis Hayata 苗栗冬青
- Ilex cochinchinensis (Lour.) Loes. 革葉冬青
- Ilex crenata Thunb. 假黃楊
- Ilex ficoidea Hemsl. 臺灣糊樗
- Ilex formosana Maxim. 糊樗
- Ilex goshiensis Hayata 圓葉冬青
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