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- Fabaceae 豆科 97 屬 295 種 96 屬 293 種
- Fabroniaceae 碎米苔科 6 屬 10 種 6 屬 10 種
- Facelinidae 6 屬 14 種 6 屬 14 種
- Fagaceae 殼斗科 7 屬 71 種 7 屬 71 種
- Falconidae 隼科 1 屬 12 種 1 屬 12 種
- Falculiferidae 鴿羽蟎科 2 屬 2 種 2 屬 2 種
- Fanniidae 廁蠅科 2 屬 15 種 2 屬 15 種
- Farysiaceae 1 屬 3 種 1 屬 3 種
- Fasciolariidae 旋螺科 13 屬 45 種 13 屬 46 種
- Fasciolidae 片形吸蟲科 1 屬 1 種 1 屬 1 種
- Faucheaceae 葉囊藻科 1 屬 1 種 1 屬 1 種
- Felidae 貓科 3 屬 3 種 3 屬 3 種
- Fellodistomidae 壯穴科 1 屬 1 種 1 屬 1 種
- Fenestellaceae 1 屬 1 種 1 屬 1 種
- Fibulariidae 豆海膽科 2 屬 3 種 2 屬 3 種
- Ficidae 枇杷螺科 1 屬 4 種 1 屬 4 種
- Figitidae 環腹癭蜂科 4 屬 5 種 4 屬 5 種
- Filistatidae 縮網蛛科 1 屬 1 種 1 屬 1 種
- Filoviridae 絲狀病毒科 3 屬 4 種 3 屬 4 種
- Fimbriidae 花籃蛤科 1 屬 2 種 1 屬 2 種
- Fissidentaceae 鳳尾苔科 1 屬 65 種 1 屬 63 種
- Fissurellidae 裂螺科 11 屬 35 種 11 屬 35 種
- Fistulariidae 馬鞭魚科 1 屬 2 種 1 屬 2 種
- Fistulinaceae 牛排菌科 1 屬 1 種 1 屬 1 種
- Flabellidae 扇形珊瑚科 10 屬 29 種 10 屬 29 種
- Flabellinidae 扇羽海蛞蝓科 1 屬 4 種 1 屬 4 種
- Flagellariaceae 鞭藤科 1 屬 1 種 1 屬 1 種
- Flatidae 青翅飛蝨科 9 屬 12 種 9 屬 12 種
- Flaviviridae 黃熱病毒科 2 屬 21 種 2 屬 21 種
- Flavobacteriaceae 黃桿菌科 20 屬 50 種 20 屬 50 種
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