參加2010年動物行為、生態暨生物教育研討會-中國生物學會暨中華民國魚類學會聯合年會心得

January 22nd, 2010 No comments

活動網頁:http://www.bio.ncue.edu.tw/arr/actnews.php?Sn=1

活動時間:2010-01-20 ~ 2010-01-21

活動地點:國立彰化師範大學進德校區

可以在 TaiBIF 新增的功能:

  1. Darwin Core 格式的介紹網頁。
  2. 讓使用者下載出現記錄的點位資料。 Read more…
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漫談政府資訊上網

January 19th, 2010 No comments

筆者於2009年參加TDWG年會時,聽到一位講者介紹關於linked open data 時,講者順道提了英國目前由Tim Berners-Lee進行資料公開上網的消息,而他們所採用的技術為RDFa,希望透過這種Light-Weight RDF可以有效的整合目前存在網路上的「公開資訊」。

傳統上而言Web 提供是一個豐富的分散式的資訊,一個HTML文件可能包含一個標題,接下來用小字型寫了一個子標題、一個斜體、粗體等方式表達網頁的具體內容,最後在包含幾個超鏈結的網址,而現今的網頁中大都遵循這樣的架構,然而這樣的透過瀏覽器的解讀變成人類可以思考理解,對機器而言它卻不知到哪些是文章的標題、哪些是發表日期、哪些是分類的連結,機器與人類的理解存在一些gap。

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TAPIRLINK 進行中文資料 mapping 的修改

January 7th, 2010 No comments

  在”如何利用TAPIR進行中文資料的mapping”文章中告訴各位如何利用 TAPIRLINK 軟體分享資料中的中文欄位,但是因為檔案的遺漏跟錯誤,於是 TaiBIF 進行了一些修正,如果您有對映 http://140.109.29.92/tapirlink/darwinxml/darwin_c.xml 這個檔案的話請您先按圖一中的 unmap 按鈕後再依照”如何利用TAPIR進行中文資料的mapping”重新對映一次。

圖一 Read more…

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解決javascript被flash覆蓋的方法

December 22nd, 2009 No comments

現在的網站常使用javascipt製作目錄式選單,另外一方面因為youtube影音平台的快速興起,非常容易在網站上嵌入一段影片。

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只要貼上這段HTML語法到網頁上即可。
但如果你的網頁上有使用Javascript的語法,就會出現選單被這段影片所覆蓋,解決的方法參考http://kb2.adobe.com/cps/142/tn_14201.html,只要修改兩個地方
2009-12-22_165841

TDWG 介紹

December 1st, 2009 No comments

分類學資料庫工作小組(Taxonomic Databases Working Group, TDWG)於1985年正式成立時,主要是解決世界上主要的植物標本館之間標本資訊整合為首要目標,至1994年時,IUBS(International Union of Biological Sciences)決定其拓至其它生物領域,發展至今目前TDWG的成員已包含世界各國動物學、地質學、微生物學等典藏研究機構,2008年起並將組織名稱加上生物多樣性資訊標準(Biodiversity Information Standards),希望可以透過TDWG協助制定與解決更多資料交換與整合的問題。而在目前全球生物多樣性資訊整合的分工架構中,TDWG扮演著技術研發及資料標準與推廣的角色,就今日世界上主要的生物多樣性資訊服務提供者如各標本館、博物館、全球生物多樣性資訊機構、生命大百科等,其資料庫系統與資訊架構均與TDWG關係密切。而台灣數位典藏計畫中生物主題小組所採用Darwin core,也是該組織所推動制定,另外TDWG資訊擷取存取協定(TAPIR) 是近年TDWG積極推廣,並獲得全球生物多樣性資訊機構(GBIF)、世界各博物館、甚至台灣數位典藏計畫所採用。
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全部生物應分為幾界? 于名振 2001【動物系統分類綱要】代序

October 28th, 2009 No comments

于名振  台灣東海大學生物系 

  地球上已經被生物學家鑑定命名的生物約有一百八十萬種,其中包括約二十六萬種植物,五萬種脊椎動物,八十餘萬種昆蟲。而每年被新鑑定發表而增加的生物不下數千種。據估計未被發現並命名的生物尚有二千萬至五千萬種之多。再加上那些掩埋地層中難以數計的化石生物,種數更是驚人。這樣龐大繁雜的生物類群,如何根據其形體結構的繁簡異同,加以歸納整合,而成為一個有一定秩序的分類系統,從而正確地顯現其間或近或疏的親緣關係,提供為深入研究的基礎,便成為當今生物分類學家非常重要的研究課題。 Read more…

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分「界」背後更重要的意義 古訓銘

October 28th, 2009 No comments

古訓銘  中央研究院生物多樣性研究中心 

  現在學術界在生物界級的分類上頗混亂(實際上每一個階級都混亂),有很多不同的分類系統。從我們的資料庫名錄可以看出來真核生物部分的分界是採用 Cavalier-Smith 的分類系統,但是在這個系統是把生物分為六界,而不是七界,病毒沒有被算在內。會變成七界的原因是因為「三域說」的興起,所以再將原核生物分為細菌與古菌。 Read more…

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系統分類學的演進 邵廣昭

October 28th, 2009 No comments

邵廣昭  中央研究院生物多樣性研究中心 

一、 為何生物要命名及分類分類學之父,瑞典的植物學家,林奈(Carolus Linnaeus, 1707~1778) (圖一)
       為紀念達爾文誕辰兩百週年(Charles Darwin 200),全球各地在2009年正紛紛舉辦各種演化論的研討會。相形之下,2007年剛度過三百週年誕辰的分類學之父,瑞典的植物學家,林奈(Carolus Linnaeus, 1707~1778) (圖一),就好像失色不少。這多少也反映了時下生物學界重演化而輕分類的現象,常以為分類是門傳統落伍的學科,只需要在博物館內的少數學者來進行即可,演化才是尖端創新、可登堂奧的生命科學。殊不知生命科學的研究起源於分類工作,且奠基於分類學,如果沒有林奈首創二名法(制)(binomial system),把各種生物統一命名,即以拉丁文給予一個屬名加上種小名的學名;並建立一個界、門、綱、目、科、屬、種的有階層、有系統的分類架構。否則地球上的同種生物迄今可能還是各命其名,各行其是。 Read more…

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台灣物種名錄分界說明

October 28th, 2009 No comments

洪鈴雅1、顏聖紘2、邵廣昭 1. 
 (1.中央研究院生物多樣性研究中心     2. 中山大學生物科學系)
  
  分類學家對於一個理想生物分類系統的期待乃是藉由這些分類層級的安排反映各分類群的起源以及它們之間的關係。分類學家依據化石、現生的生物構造、核酸或蛋白質序列,透過親緣關係重建等等方式,提出各種演化假說並據以修訂分類架構。隨著新證據與新技術的發展,以及分類學基礎理論不斷地被修飾,舊的分類架構不斷地被驗證與修訂。

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TaiBIF 地圖服務需求規劃

October 19th, 2009 No comments

TaiBIF 地圖服務需求規劃

接續上篇「TaiBIF 地圖服務建置歷程」,因此TaiBIF的地圖規劃必須包含下面幾項功能:

  • 呈現不同條件的物種分布狀況:地圖服務最為基礎的功能為顯示不同條件下的物種分布狀況,從單一物種分布、甚至某一分類群(從界、門、綱、科、屬)的高階分類的分布情況;或某人過去的採集記錄;甚至大到一整個資料集的分布狀況,均可以透過TaiBIF的地圖服務呈現。
  • 以地圖方式搜尋某一地區物種分布:若有特定需求想查詢某一地點標本的資料,可以利用系統平台上地理空間框選的功能以獲得該地區資訊。步驟如下:

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